Film ini mengisahkan pada tahun 1582, Oda Nobunaga hampir saja berhasil menguasai seluruh wilayah Jepang walau akhirnya rencana ini harus gagal karena ia dipaksa bunuh diri oleh salah seorang jenderalnya di kuil Honno-ji. Namun Akechi Mitsuhide yang memaksa Oda Nobunaga bunuh diri juga tak bertahan lama sebagai pucuk pimpinan.

Tak lama berselang, Toyotomi Hideyoshi menggeser Akechi Mitsuhide dan melanjutkan impian Oda Nobunaga mempersatukan seluruh wilayah Jepang. Ketika impian itu jadi kenyataan, untuk sementara waktu wilayah Jepang diliputi kedamaian namun harus berakhir ketika wilayah itu diteror seorang ninja bernama Ishikawa Goemon (Yosuke Eguchi).

Goemon memiliki kekuatan di luar batas kemampuan manusia dan ia memanfaatkannya untuk mencuri dari orang kaya dan membagi-bagikan harta jarahan tersebut untuk rakyat miskin. Segera saja Goemon menjadi buron pemerintah, apalagi ketika Goemon berhasil menemukan sebuah benda dari masa lalu yang menjadi kunci dari kekuatan yang tak terbayangkan.